Ciao,
che potenza ha il motore? Se è molto sovradimensionato, magari per un impianto preesistente, se il rifasamento è stato fatto non tenendo conto della potenza del motore bensì di quella producibile e il tuo collegamento è in Media Tensione con perdite anche sul trasformatore potrebbe starci sia la forte differenza di corrrenti, sia la potenza molto più bassa di quella che ti aspetti. Fai attenzione, perchè se non rifasi correttamente in certi casi rischi di pagare penali salate. Un'altra ipotesi potrebbe essere un errore sul rapporto di trasformazione dei TA, cioè dei riduttori di corrente per le misure, o l'eventuale non corretta impostazione di tali rapporti nello strumento che ti visualizza le correnti. Ciò che sicuramente devi fare è verificare il fattore di potenza e/o installare uno strumento che te lo indichi e controllare le correnti e la potenza con uno strumento portatile; misurare sempre con la stessa apparecchiatura escluderebbe errori di inserzione degli strumenti.
Sono solamente ipotesi, quindi potrebbero essere completamente sbagliate, con più informazioni sarebbe più facile identificare il problema.